Program Magister Teknik Sipil (MTS) UMS didirikan berdasarkan SK Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi No.2555/D/T/2001 dan telah terakreditasi B kembali berdasarkan SK BAN-PT No 469/BAN-PT/Akred/M/XII/2014. Program studi MTS dipercaya sebagai penyelenggara Beasiswa Pendidikan Pascasarjana Dalam Negeri (BPPDN) melalui surat persetujuan Direktur Pendidik dan Tenaga Kependidikan Kemendiknas nomor 2778/E4.4/2011. Tahun 2019, Prodi MTS telah terakreditasi A berdasarkan SK BAN PT No 3867/SK/BANPT/Akred/M/X/2019.
